Pada 14 Desember 2020, Inggris melaporkanvarian SARS-CoV-2 yang menjadi perhatian (VOC), garis keturunan B.1.1.7,juga disebut sebagai VOC 202012/01 atau 20I/501Y.V1.*Varian B.1.1.7 diperkirakan muncul pada bulan September2020 dan dengan cepat menjadi sirkulasi dominanvarian SARS-CoV-2 di Inggris (1).B.1.1.7 telahterdeteksi di lebih dari 30 negara, termasuk Amerika Serikat.Sebagaiper 13 Januari 2021, sekitar 76 kasus B.1.1.7telah terdeteksi di 12 negara bagian AS.Beberapa baris buktimenunjukkan bahwa B.1.1.7 ditransmisikan lebih efisien daripada yang adavarian SARS-CoV-2 lainnya (1–3).Lintasan yang dimodelkan darivarian ini di AS menunjukkan pertumbuhan pesat pada awal 2021,menjadi varian dominan di bulan Maret.DitingkatkanPenularan SARS-CoV-2 dapat mengancam perawatan kesehatan yang tegangsumber daya, membutuhkan implementasi yang diperluas dan lebih ketatstrategi kesehatan masyarakat (4), dan meningkatkan persentasekekebalan populasi yang diperlukan untuk pengendalian pandemi.Memukaulangkah-langkah untuk mengurangi penularan sekarang dapat mengurangi potensidampak B.1.1.7 dan memberikan waktu kritis untuk meningkatkan vaksincakupan tion.Secara kolektif, peningkatan pengawasan genomikdikombinasikan dengan kepatuhan berkelanjutan dengan publik yang efektiflangkah-langkah kesehatan, termasuk vaksinasi, jarak fisik,penggunaan masker, kebersihan tangan, dan isolasi dan karantina, akanpenting untuk membatasi penyebaran virus SARS-CoV-2yang menyebabkan penyakit coronavirus 2019 (COVID-19).Strategispengujian orang tanpa gejala tetapi berisiko lebih tinggiinfeksi, seperti mereka yang terpapar SARS-CoV-2 atau yang memilikikontak yang sering tidak dapat dihindari dengan publik, memberikan yang lainkesempatan untuk membatasi penyebaran yang sedang berlangsung.

Pengawasan genomik global dan shar sumber terbuka yang cepaturutan genom virus telah difasilitasi hampir secara real-timedeteksi, perbandingan, dan pelacakan perkembangan SARS-CoV-2varian yang dapat menginformasikan upaya kesehatan masyarakat untuk mengendalikanpandemi.Padahal beberapa mutasi pada genom virusmuncul dan kemudian surut, orang lain mungkin memberikan advan selektiftage ke varian, termasuk transmisibilitas yang ditingkatkan, sehinggavarian seperti itu dapat dengan cepat mendominasi varian lain yang beredar.

Di awal pandemi, varian SARS-CoV-2 mengandungmutasi D614G pada protein spike (S) yang meningkataviditas mengikat reseptor dengan cepat menjadi dominan di banyakwilayah geografis (5,6).Pada akhir musim gugur 2020, beberapa negara melaporkan terdeteksivarian SARS-CoV-2 yang menyebar lebih efisien.Selain ituke varian B.1.1.7, varian terkenal termasuk B.1.351garis keturunan pertama terdeteksi di Afrika Selatan dan baru-baru ini diidentifikasiB.1.1.28 subclade (berganti nama“Hal.1”) terdeteksi di empat wisatawandari Brazil selama pemeriksaan rutin di Haneda (Tokyo)Bandara.§ Varian ini membawa konstelasi mutasi genetiktermasuk dalam domain pengikat reseptor protein S,yang penting untuk mengikat angiotensin- sel inangmengubah reseptor enzim-2 (ACE-2) untuk memfasilitasi viruspintu masuk.Bukti menunjukkan bahwa mutasi lain ditemukan di dalamnyavarian mungkin tidak hanya memberikan peningkatan transmisibilitas tetapi jugamungkin juga memengaruhi kinerja beberapa waktu-nyata diagnostiktranskripsi terbalik–reaksi berantai polimerase (RT-PCR)tes¶ dan mengurangi kerentanan terhadap antibodi penawar(2,3,5–10).Laporan kasus baru-baru ini mendokumentasikan kasus pertamaInfeksi ulang SARS-CoV-2 di Brasil dengan varian SARS-CoV-2yang berisi mutasi E484K,** yang telah ditunjukkanuntuk mengurangi netralisasi dengan sera konvalesen dan monoklonalantibodi (9,10).

Laporan ini berfokus pada munculnya varian B.1.1.7di Amerika Serikat.Pada 12 Januari 2021, tidak ada keduanyaB.1.351 maupun varian P.1 telah terdeteksi diAmerika Serikat.Untuk informasi tentang munculnya SARS-CoV-2varian yang menjadi perhatian, CDC mengelola halaman web yang didedikasikan untukmemberikan informasi tentang varian SARS-CoV-2 yang muncul.††

 B.1.1.7 silsilah (20I/501Y.V1)

Varian B.1.1.7 membawa mutasi pada protein S(N501Y) yang mempengaruhi konformasi pengikatan reseptordomain.Varian ini memiliki 13 mutasi penentu garis keturunan B.1.1.7 lainnya (Tabel), beberapa di antaranya ada dalam protein S,termasuk penghapusan pada posisi 69 dan 70 (del69–70) ituberevolusi secara spontan dalam varian SARS-CoV-2 lainnya dandihipotesiskan untuk meningkatkan transmisibilitas (2,7).Penghapusanpada posisi 69 dan 70 menyebabkan S-gen target failure (SGTF)dalam setidaknya satu RT-PCR–assay diagnostik berbasis (yaitu, denganTes ThermoFisher Taq Path COVID-19, varian B.1.1.7ant dan varian lainnya dengan del69–70 menghasilkan negatifhasil untuk target gen S dan hasil positif untuk dua lainnyasasaran);SGTF telah berfungsi sebagai proxy di Inggris Rayauntuk mengidentifikasi B.1.1.7 kasus (1).Berbagai bukti menunjukkan bahwa B.1.1.7 lebih dari ituditransmisikan secara efisien dibandingkan dengan SARS-CoV-2 lainnyavarian yang beredar di Inggris Raya.wilayah Inggris denganproporsi urutan B.1.1.7 yang lebih tinggi memiliki epidemi yang lebih cepatpertumbuhan daripada daerah lain, diagnosis dengan SGTF meningkatlebih cepat daripada diagnosis non-SGTF di area yang sama, dan aproporsi kontak yang lebih tinggi terinfeksi oleh pasien indeksdengan infeksi B.1.1.7 dibandingkan dengan pasien indeks yang terinfeksivarian lainnya (1,3).Varian B.1.1.7 berpotensi meningkatkan pan ASlintasan demic dalam beberapa bulan mendatang.Untuk mengilustrasikan efek ini,model kompartemen sederhana dua varian dikembangkan.Prevalensi B.1.1.7 AS saat ini di antara semua yang beredarvirus tidak diketahui tetapi dianggap <0,5% berdasarkanjumlah terbatas kasus yang terdeteksi dan data SGTF (8).Untukmodel, asumsi awal termasuk prevalensi B.1.1.70,5% di antara semua infeksi, kekebalan SARS-CoV-2 dariinfeksi sebelumnya 10%–30%, reproduksi bervariasi waktuangka (R t ) dari 1.1 (dikurangi tetapi meningkatkan transmisi)atau 0,9 (penurunan penularan) untuk varian saat ini, dan kejadian yang dilaporkan 60 kasus per 100.000 orang per hari pada1 Januari 2021. Asumsi ini tidak tepat mewakilisetiap lokasi AS tunggal, melainkan, menunjukkan generalisasikondisi umum di seluruh negeri.Perubahan R t selesaiwaktu yang dihasilkan dari kekebalan yang didapat dan peningkatan prevalence dari B.1.1.7, dimodelkan, dengan asumsi B.1.1.7 R tmenjadi konstanta 1,5 kali R t varian saat ini, berdasarkanperkiraan awal dari Inggris (1,3).Selanjutnya, potensi dampak vaksinasi dimodelkandengan asumsi bahwa 1 juta dosis vaksin diberikan perhari mulai 1 Januari 2021, dan kekebalan 95% itudicapai 14 hari setelah menerima 2 dosis.Secara khusus,kekebalan terhadap infeksi baik dengan varian saat ini atauVarian B.1.1.7 diasumsikan, meskipun efektivitas dandurasi perlindungan terhadap infeksi masih belum pasti,karena ini bukan titik akhir utama uji klinisuntuk vaksin awal.Dalam model ini, prevalensi B.1.1.7 awalnya rendah, namun karenaitu lebih dapat ditularkan daripada varian saat ini, yang ditunjukkannyapertumbuhan yang cepat di awal tahun 2021, menjadi varian yang dominansemut di bulan Maret (Gambar 1).Apakah transmisi arusvarian meningkat (R t awal = 1,1) atau perlahan menurun(awal R t = 0,9) pada bulan Januari, B.1.1.7 mendorong perubahan substansialdalam lintasan transmisi dan fase baru eksponensialpertumbuhan.Dengan vaksinasi yang melindungi dari infeksi,lintasan epidemi awal tidak berubah dan B.1.1.7 menyebarmasih terjadi (Gambar 2).Namun, setelah B.1.1.7 menjadivarian dominan, transmisinya berkurang secara substansial.Pengaruh vaksinasi dalam mengurangi penularan dalam waktu dekatistilah terbesar dalam skenario di mana transmisi itusudah menurun (R t awal = 0,9) (Gambar 2).Upaya awal itudapat membatasi penyebaran varian B.1.1.7, seperti universal danpeningkatan kepatuhan dengan strategi mitigasi kesehatan masyarakat,akan memungkinkan lebih banyak waktu untuk vaksinasi berkelanjutan untuk mencapai yang lebih tinggikekebalan tingkat populasi.

Diskusi

Saat ini, tidak ada perbedaan yang diketahui dalam hasil klinisterkait dengan varian SARS-CoV-2 yang dijelaskan;Namun,tingkat penularan yang lebih tinggi akan menyebabkan lebih banyak kasus, meningkatjumlah orang secara keseluruhan yang membutuhkan perawatan klinis, exacermeringankan beban pada sistem perawatan kesehatan yang sudah tegang,dan mengakibatkan lebih banyak kematian.Pengawasan genom lanjutanuntuk mengidentifikasi kasus B.1.1.7, serta munculnya kasus lainnyavarian yang menjadi perhatian di Amerika Serikat, penting untukTanggap kesehatan masyarakat COVID-19.Sedangkan hasil SGTFdapat membantu mengidentifikasi potensi kasus B.1.1.7 yang dapat dikonfirmasidengan mengurutkan, mengidentifikasi varian prioritas yang tidak ditampilkanSGTF bergantung secara eksklusif pada pengawasan berbasis urutan.